Das Petrus-Krankenhaus ist eine Einrichtung des Klinikverbundes St. Antonius und St. Josef, einer Gesellschaft der Stiftung der Cellitinnen. Geschäftsführer des Klinikverbundes sind Adelheid May (Sprecherin der Geschäftsführung), Benjamin Koch und Dr. Martin Grunewald.
Die Klinikdirektion des Petrus-Krankenhauses widmet sich den wirtschaftlichen und organisatorischen Rahmenbedingungen des Klinikbetriebes. Ausstattung, Zuschnitt und Zusammenarbeit der einzelnen Einrichtungen stehen dabei im Zentrum der koordinierenden Arbeit der Klinikdirektion. Diese Arbeit geschieht auf der Basis eines deutlichen Anspruchs: Werte sollen verbindlich gelebt, Maßstäbe als verbindlich erlebt werden, der Charakter eines katholischen Krankenhauses in Haltung und Begegnung deutlich werden.
Die Prämisse des Handelns der Klinikdirektion lautet: Die Glaubwürdigkeit, die Akzeptanz und damit der Erfolgt des Handelns hängt von der Einbeziehung aller Verantwortungsträger ab. Damit kommt der Kommunikation auf den verschiedenen Dienst- und Entscheidungsebenen große Bedeutung zu. Ihr wird durch die Klinikdirektion über die Einrichtung von Leitungsgremien und den entsprechenden Organisationsstrukturen Rechnung getragen. Beispielhaft sind hierfür